鄂尔多斯市蒙古族中学的渊源，可以追溯到1938年创建的国立伊盟中学。该校开始只招收蒙古族学生，实施蒙汉语教学，培养民族自治人才。历经战火考验，几经迁徙易名，建国后才得以稳定下来。1952年，国立伊盟中学改名伊克昭盟中学。
1955年，顺应民族教育的发展需求，经自治区人民政府批准，并受命伊克昭盟中学筹建蒙古语授课中学。1956年，伊克昭盟第二中学肩负发展民族教育事业的使命，从伊克昭盟中学中分化出来，成为伊盟首所蒙语授课完全中学。
“文革”动乱期间，伊克昭盟第二中学曾下放东胜县管辖二年，1973年恢复建制后改称伊克昭盟民族中学。1978年，学校被列为全盟首批重点中学。1985年更名为伊克昭盟蒙古族中学。2001年撤盟设市，学校相应更名为鄂尔多斯市蒙古族中学。
2012年，学校整体搬迁至康巴什新区新建校址。校园占地面积约324亩，按照“学习式部落”理念建设。校区设计新颖时尚，建筑美观大方，布局错落有致，环境整洁有序，设施精良完备，是一所充满活力和现代气息的学校。
学校现有高中班24个，初中班6个，在校生1000余人，基本实现小班化管理。现有在编教职工182人，其中高级教师78人，特级教师5人，全国优秀教师2人，自治区优秀教师6人，国家级“五一劳动奖章”获得者1人，自治区“五一劳动奖章”获得者2人，自治区级学科带头人5个、教学能手6个，自治区青年教师优质课及基本功大赛获奖教师14人，鄂尔多斯市级学科带头人、教学能手41人，获自治区、鄂尔多斯市先进班集体的班主任有33人次，有各学科的多名教师参与了全国蒙语授课教材的编审工作。教师队伍精干，专业功底厚，治学严谨，协作能力强，热衷于民族教育事业。
近年来，学校坚持“草原胸怀·国际视野”的办学理念，以培养“身心健康、品德优良、基础扎实、特长鲜明”的新型人才为目标，抢抓机遇，开拓进取，围绕课程改革工作，积极探索实践“过程完整化教学模式”、“导学模式”和“反转课模式”，加强特色课程建设，突出常规教学“五个环节”工作，在教育教学质量的稳步提升和学生全面发展方面取得显著成效。
高考本科升学率逐年上升。自2008年以来，高考本科升学率一直保持在88%以上。2015年高考本科一本上线率达到76%。历年高考中，理科最高分曾达到602分；文科最高分曾达到584分。
特色课程建设效果显著。加强特色课程建设，活跃体育艺术社团，促成信息技术与蒙古文教育教学的融合、播音主持专业课以及体育类特色课程等自治区示范性普通高级中学示范项目的产生。
在各级领导的关怀、社会各界的支持以及全体师生的努力下，学校先后获得“自治区级体育传统项目学校”、“学习使用蒙古语文模范集体”、“自治区民族教育科研实验示范学校”、“自治区基层党组织建设示范点”、鄂尔多斯市“普通高中教学工作先进学校”、鄂尔多斯市“先进基层党组织”、“全市教育系统先进集体”等荣誉称号，并列入全盟首批重点中学和自治区优质高中行列。
如今，鄂尔多斯市蒙古族中学正以“正气 朝气 大气”的校风，“爱心 耐心 匠心”的教风，“乐学 善思 践行”的学风以及“责任 合作 进取”的学校精神，迈开步伐，为创建在区内外有较高影响力的特色鲜明的现代蒙古族中学而不懈奋斗。
鄂尔多斯中考
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