郭登在宪宗即位后恢复为伯并充任甘肃总兵官，于成化八年病逝于京城，宪宗闻讯后赐祭葬

郭登在宪宗即位后恢复为伯，以至于卖掉妻子儿女来筹钱，成化四年朝廷复设十二团营，命郭登偕同朱永提督

宪宗即位后，下诏恢复郭登为伯，命他充任甘肃总兵官。郭登上奏说边军买马十分艰难，以至于卖掉妻子儿女来筹钱，因而请求借用楚、庆、肃三王府的马各一千匹，由官府付钱。皇上采纳了他的建议。由朱永等推荐，郭登应诏掌管中府事务，总神机营兼提督十二营诸军事。此后郭登多次以疾病为由辞职，宪宗均不允。成化四年（1468年），朝廷复设十二团营，命郭登偕同朱永提督。

郭登于成化八年病逝于京城追封定襄侯，谥号忠武，并赐祭葬

成化八年（1472年）四月丙申（6月5日） ，郭登病逝于京城，宪宗闻讯后，为他辍朝一日，追封定襄侯，谥号忠武，并赐祭葬。
郭登无子，以其兄之子郭嵩为子。郭登被贬至甘肃时，将家人留在京城，郭嵩克扣衣食。郭登之妾靠缝纫自给，几乎活不下去了，他也不关心。郭登回京后，想废黜他，因为他是会昌侯的女婿，会昌侯曾救过自己的命，所以才忍住没有发作。郭登死后，郭嵩承袭爵位。后来因为不是郭登嫡子继嗣，所以只有郭嵩一人承袭爵位，其子郭参被降为锦衣卫指挥使。
在明代黄道周所著的《广名将传》中，郭登位列其中