作者：方从哲
方从哲进谏，希望能够去位让贤，并以补阁臣、补大僚、补言官、发帑金四事以请
此时，正为神宗“虚心接受，坚决不改”态度而头痛的方从哲，亦倍感边事日重，故曾经奏言：「军国重事，断非病夫绵力所能承担，兹者边报纷纭，日繁圣听，如臣寡昧，何能运一筹、决一策，以纾九重霄旰之忧。」希望能够去位让贤，并以补阁臣、补大僚、补言官、发帑金四事以请，然而奏疏均为神宗留中。
不过面对为难局势，神宗还是有所振作。毕竟此时形势已无法让他无为而治下去。
万历四十六年五月二十七日，由兵部召开的九卿科道会议后，杨镐成为辽东经略，其余大员也陆续诏用。包括「诏总督侍郎汪可受先出关，代李维翰驻辽阳，保定抚臣驻易州，御史陈王庭代杨一桂巡按辽东，以废将李如柏总辽镇兵，及征废将杜松屯山海关，刘綎、柴国柱等赴京听用。」
不过主要佐理杨镐弭平奴儿哈赤的将领，分别为李如柏、杜松、马林、刘綎等四员。
兵力方面，虽然已接连损兵折将，但“主客兵丁，各四万有奇”，不久川陕强兵相继援辽，总兵力达到10多万（一说13万）。建州叛军方面，总兵力10万有余，战兵大约4万人。明军似乎占有一定优势。
虽然如此，但明军将领离心，上下解体；军饷欠发，兵多虚报；器械不修，情报外泻，可谓隐患重重。
方从哲推举楚党人士，曾任辽东巡按的熊廷弼出任辽东经略，局势逐步稳定
举例而言：当时杨镐的计划，交众人先商议然后定，以至于邸报上竟白纸黑字写出“XX将率大兵XX万，从XX出师，往XX地方”，虽然在己方实力上或有所夸大，但是总体计划暴露无疑。以至于当时并不参与机密的徐光启（正遭讦，称病去职，屯耕于天津）也能看到，还写信给朋友称敌人必然将四路大军各个击破，“当之者必杜将军也”。其他可知！叛军不用像有的书上记载那样由杨镐或李如柏小妾告知，就可以轻松得到情报，制定相应方略。
结果自不待言，万历四十七年二月九万大军兵出边墙，围攻赫图阿拉。之后双方爆发萨尔浒战役，明军被各个击破，88550余名出阵官兵损失46000余人。随征的朝鲜军全军覆灭。
至此，全国震动，方从哲的上书称“自有辽东警报以来，大小臣工无不骇愕，而民间尤甚。加以山海关，又有虏报，人心愈益恐怖，讹言四起，各思奔窜。官吏士民以及商贾，向寓京师者率多，携家避难而去，且迩来四方饥民就食来京者，不知几千万”。350万两白银的军费，也随着战斗的失败打了水漂。
其后，经过方从哲等人会推，楚党人士，东林在言路的死敌之一，曾任辽东巡按的熊廷弼出任辽东经略，局势逐步稳定。