崔佑甫盛行耿直直言不讳，在朝政事务上与宰相常衮常常意见不一而受常衮嫉恨

崔佑甫自幼勤奋好学，通过科举步入仕途
崔祐甫早年考中进士，授为寿安县尉。他生性刚直，遇事不肯回头，历任起居舍人、吏部司勋员外郎、御史中丞、永平军行军司马、中书舍人。

 
崔佑甫与常衮二人在政事上常常意见相左，关系恶劣
大历十三年（778年），中书侍郎之职出缺。崔祐甫以舍人之职处理中书省事务，多次与宰相常衮发生争执，而且不肯妥协。常衮大怒，奏请皇帝，改让崔祐甫主持吏部铨选。崔祐甫拟定的官员人选，大都被常衮驳回，二人由此交恶。 
后来，陇右节度使朱泚军中发生猫鼠同乳之事，向朝廷奏称祥瑞，常衮便率群臣庆贺。而崔祐甫却认为：“养猫是要它捕食老鼠，为人除害。今猫不捕鼠反而哺乳老鼠，是失其本性，不能守职，就如同官吏不惩处违法之人，边将不抵抗入侵之敌。我认为应当派人巡察地方贪官污吏，告诫边防守将严加防范，则可以消除这种怪异现象。”唐代宗表示赞同，常衮由此更加厌恶崔祐甫。